Rumah Sakit Pemerintah :
Rumah Sakit Pemerintah yang ada di Kabupaten Flores Timur adalah Rumah Sakit Umum Daerah(RSUD) dr. Hendrikus Fernandez Larantuka
Puskesmas :
Kabupaten Flores Timur Memiliki 21 Puskesmas yang tersebar di seluruh kecamatan yang ada di Kabupaten Flores Timur.
Puskesmas Pembantu
Polindes
Posyandu