Bupati Flores Timur dari Masa ke Masa

No. Nama Bupati dan Wakil Bupati Tahun Memimpin
1. Stefanus Ndoen 1959 – 1961
2. Yoakim Bl. De Rosary 1961- 1966
3. C. Y. Monteiro 1966 – 1973
4. Drs. Anton Buga Langoday 1973 – 1978
5. Letkol Markus Weking 1978 – 1983
6. Letkol Simon Petrus Soliwoa 1983 – 1989
7. Letkol H. Iskandar Munthe 1989 – 1994
8. Drs. H. Hengki Mukin, SH 1994 – Januari 2000
9. Drs. Landoaldus Mekeng
(Plt. Bupati Flores Timur) Pebruari
2000-April 2000
10. Felix Fernandez, SH, CN (Bupati)
Yohanes Payong Beda, SH (Wabup)
2000 – 2005
11. Dr. Husein Pancratius
(Penjabat Bupati Flores Timur)
April 2005 – Agustus 2005
12. Drs. Simon Hayon (Bupati)
Yoseph Lagadoni Herin, S.Sos (Wabup)
2005 – 2010
13.

Drs. Muhammad S. Wongso
(Penjabat Bupati Flores Timur)
Agustus 2010 – 2011
14.

Yosep Lagadoni Herin, S.Sos (Bupati)
Valentinus Tukan, S.Ap (Wabup)
2011 – 2016